A 2009-2010-es szezonban a Leverkusent erősítette kölcsönben, idén azonban a rekordbajnok stabil tagja: Kroos idén eddig 21 bajnoki mérkőzésen lépett pályára és egy találatot szerzett.
"Nagyon örülök, hogy a klubnál számítanak rám - nyilatkozta a labdarúgó. - Igazán otthon érzem magam, a csapatban betöltött szerepem pedig tovább motivál. Biztos vagyok benne, hogy az előttünk álló időszakban sikeres lesz a Bayern München."