Az orvosok tájékoztatása szerint a 43 éves szakember szervezete annyira elhasználódott 14 éves játékos pályafutása alatt, hogy mindenképpen szükség volt a beavatkozásra. Bilic 2006-ban vette át a horvát nemzeti csapat irányítását, s az együttessel kijutott a nyári, lengyel-ukrán közös rendezésű Európa-bajnokságra is.